Những chia rẽ xảy ra giữa các Giáo hội bên Tây và bên Đông:
Kitô giáo đã được rao giảng ngay từ thời Ðế quốc Roma. Thời đó, Đế quốc lớn này được chia thành hai phần: Bên Tây nói tiếng Latinh và bên Đông thuộc nền văn hóa Hy Lạp. Các Giáo hội bên Tây, đặt trụ sở tại Roma theo lễ nghi Latinh, và các Giáo hội bên Đông, theo lễ nghi Bizantin hay Hy Lạp, đặt trụ sở tại Constantinopoli (Thành nhĩ kỳ). Mặc dù theo hai lễ nghi khác nhau, hai Giáo hội này vẫn hiệp nhất và hiệp thông dưới sự lãnh đạo của một Vị Chủ chăn tối cao, tức là Giám mục Roma, Ðấng kế vị Thánh Phêrô.
Nhưng chia rẽ giữa các Giáo hội bên Tây và bên Đông xảy ra vào năm 1054, khi Giáo hội bên Tây thêm vào Kinh Tin Kính (Công đồng Nicea-Constantinopoli) lời tuyên xưng này: “Filioque” có nghĩa là “và bởi Chúa Con”, trong tuyên xưng về Chúa Thánh Thần. Các Giáo hội theo Lễ nghi Đông phương không chấp nhận bản văn mới này của Kinh Tin Kính, mà chỉ công nhận bản văn đã được Công đồng Calcedonia năm 451 chấp nhận. Từ đó, hai Giáo hội bên Tây (Roma) và bên Đông (Constantinopoli) tách lìa nhau. Một số Giáo hội bên Đông trở lại hiệp nhất với Roma qua Thỏa ước tại Brest năm 1596. Nhưng các Giáo hội Đông phương không chấp nhận hiệp nhất với Roma và cho rằng họ là những người chính thống, trong khi các Giáo hội hiệp nhất với Roma được gọi là “Uniate” và tín hữu của họ được gọi là “những người thỏa hiệp”. Hiện nay, các Giáo hội Đông phương hiệp nhất với Roma bao gồm Giáo hội Maronites, Giáo hội Hy Lạp Công giáo Rumani, Giáo hội Syria-Malabara (đặc biệt ở miền Nam Ấn Độ), Giáo hội Ukraine và nhiều hơn nữa.
Những khác biệt giữa hai Giáo hội công giáo Roma và Giáo hội chính thống:
Về Quyền tối cao của Phêrô
Các Giáo hội chính thống không công nhận Vị Giáo Hoàng, Giám mục Roma, là thủ lãnh toàn thể Giáo hội. Họ coi ngài là “rối đạo, bè đảng”, và chỉ có họ là theo một đức tin đúng nghĩa.
Về cơ cấu quyền bính
Trong Giáo hội chính thống, quyền quyết định tối cao là Thánh Hội Nghị (Synode), cơ quan tập đoàn của các Giám mục. Trái lại, trong Giáo hội công giáo Roma, quyền quyết định tối cao thuộc về Vị Giáo Hoàng, Giám mục Roma, Thủ lãnh Tông đồ đoàn và Giám mục đoàn, đối với toàn Giáo hội. Quyền quyết định tại các Giáo hội địa phương thuộc Giám mục, được thực hiện trong hiệp nhất và hiệp thông với Vị Thủ lãnh tối cao và do Vị thủ lãnh tối cao bổ nhiệm. Cơ quan duy nhất thi hành quyền giám mục đoàn, với quyền quyết định chung cho toàn Giáo hội, là Công đồng chung, do Vị Thủ lãnh tối cao triệu tập và phê chuẩn các văn kiện. Nhờ đó, Giáo hội công giáo vẫn duy trì sự thống nhất và hiệp nhất trong tổ chức.
Về kỷ luật hôn nhân
Trong Giáo hội công giáo, hôn nhân là bất khả li chỉ chấp nhận việc tái hôn trong một số trường hợp như khi một bên qua đời hoặc khi hôn nhân được tuyên bố là không thành trong lúc kết hôn ban đầu. Trong khi đó, trong một số trường hợp, Giáo hội chính thống cho phép tái hôn.
Về Luật độc thân của các Linh mục
Các linh mục của Giáo hội công giáo không được lập gia đình và phải giữ luật độc thân để hoàn toàn phục vụ Giáo hội và các linh hồn. Ngược lại, trong Giáo hội chính thống và cả Giáo hội công giáo Đông phương, có thể có linh mục đã có gia đình trước khi được thụ phong linh mục. Tuy nhiên, linh mục chính thống và công giáo thuộc lễ nghi Đông phương, đã có gia đình, không được lên chức Giám mục.
Về Phụng vụ
Việc cử hành Thánh lễ theo nghi thức Đông Phương phức tạp hơn và kéo dài hơn so với Lễ nghi Latinh. Việc rước lễ luôn luôn dưới hai hình Bánh và Rượu là một truyền thống. Trong khi đó, trong Lễ nghi Latinh, việc rước lễ hai hình chỉ được thực hiện trong một số trường hợp đặc biệt.
Về Tín lý
Giáo hội chính thống không chấp nhận lời “Filioque” thêm vào Kinh Tin Kính, gây ra chia rẽ. Họ chỉ chấp nhận “Chúa Thánh Thần bởi Chúa Cha mà thôi”. Trong khi đó, Giáo hội công giáo chấp nhận việc thêm lời “Filioque” để tuyên xưng Chúa Thánh Thần, Ngôi thứ ba, bởi Chúa Cha và Chúa Con mà ra.
Ngoài những khác biệt trên, còn có nhiều tín điều và quy định khác nữa. Tuy nhiên, dù có nhiều sự chia rẽ, những Giáo hội này vẫn giữ được sự đa dạng và sự thống nhất trong niềm tin vào Đức Chúa Jêsus Kitô.